影响喷雾干燥器速率的因素有：样品的表面、干燥介质的温度、湿度、压力，干燥方式等。具体体现在传热速率、外扩散速率、内扩散速率等方面。
①增大面积，减小厚度 在干燥过程中，水分的蒸发都是从物料表面进行。因此，表面积越大，物料与干燥介质传热传质就越容易进行。物料厚则内扩散阻力大，扩散速率低，干燥速率低。
②干燥介质的温度 干燥介质的温度越高，带给物料的热量就越多，物料温度高有利于水分的蒸发。同时干燥介质温度高其相对湿度低，可以容纳更多的水分。在实际操作中，应结合物料实际情况合理控制温度，避免出现干燥变形或开裂。
③干燥介质的相对湿度 干燥介质的相对湿度越低，容纳水分的能力就越强。加快干燥介质流速和提高温度可以降低其相对湿度。
④干燥介质的压力 干燥介质的压力高会导致水汽的蒸发，利于水分汽化。采用减压措施可以降低干燥所需要的温度，减少干燥速率。雾滴越大，干燥速度越慢。
⑤干燥方式 干燥方式对物料的干燥速率影响很大，先进的干燥方法可以提高干燥速率，降低能耗。传统的对流干燥，传热速率慢，热扩散与湿扩散方向相反，大大影响干燥速率，如采用小型喷雾干燥器可以大大提高干燥速率。